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1.

Longitudinal Multi-omics Reveals Subset-Specific Mechanisms Underlying Irritable Bowel Syndrome.

Mars, Ruben A T; Yang, Yi; Ward, Tonya; Houtti, Mo; Priya, Sambhawa; Lekatz, Heather R; Tang, Xiaojia; Sun, Zhifu; Kalari, Krishna R; Korem, Tal; Bhattarai, Yogesh; Zheng, Tenghao; Bar, Noam; Frost, Gary; Johnson, Abigail J; van Treuren, Will; Han, Shuo; Ordog, Tamas; Grover, Madhusudan; Sonnenburg, Justin; D'Amato, Mauro; Camilleri, Michael; Elinav, Eran; Segal, Eran; Blekhman, Ran; Farrugia, Gianrico; Swann, Jonathan R; Knights, Dan; Kashyap, Purna C.

Cell ; 182(6): 1460-1473.e17, 2020 09 17.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32916129

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8109273
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2020.08.007

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2.

Defining inflammatory cell states in rheumatoid arthritis joint synovial tissues by integrating single-cell transcriptomics and mass cytometry.

Zhang, Fan; Wei, Kevin; Slowikowski, Kamil; Fonseka, Chamith Y; Rao, Deepak A; Kelly, Stephen; Goodman, Susan M; Tabechian, Darren; Hughes, Laura B; Salomon-Escoto, Karen; Watts, Gerald F M; Jonsson, A Helena; Rangel-Moreno, Javier; Meednu, Nida; Rozo, Cristina; Apruzzese, William; Eisenhaure, Thomas M; Lieb, David J; Boyle, David L; Mandelin, Arthur M; Boyce, Brendan F; DiCarlo, Edward; Gravallese, Ellen M; Gregersen, Peter K; Moreland, Larry; Firestein, Gary S; Hacohen, Nir; Nusbaum, Chad; Lederer, James A; Perlman, Harris; Pitzalis, Costantino; Filer, Andrew; Holers, V Michael; Bykerk, Vivian P; Donlin, Laura T; Anolik, Jennifer H; Brenner, Michael B; Raychaudhuri, Soumya.

Nat Immunol ; 20(7): 928-942, 2019 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31061532

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6602051
https://dx.doi.org/10.1038/s41590-019-0378-1

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3.

Child wasting and concurrent stunting in low- and middle-income countries.

Mertens, Andrew; Benjamin-Chung, Jade; Colford, John M; Hubbard, Alan E; van der Laan, Mark J; Coyle, Jeremy; Sofrygin, Oleg; Cai, Wilson; Jilek, Wendy; Rosete, Sonali; Nguyen, Anna; Pokpongkiat, Nolan N; Djajadi, Stephanie; Seth, Anmol; Jung, Esther; Chung, Esther O; Malenica, Ivana; Hejazi, Nima; Li, Haodong; Hafen, Ryan; Subramoney, Vishak; Häggström, Jonas; Norman, Thea; Christian, Parul; Brown, Kenneth H; Arnold, Benjamin F.

Nature ; 621(7979): 558-567, 2023 Sep.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37704720

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10511327
https://dx.doi.org/10.1038/s41586-023-06480-z

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4.

Early-childhood linear growth faltering in low- and middle-income countries.

Benjamin-Chung, Jade; Mertens, Andrew; Colford, John M; Hubbard, Alan E; van der Laan, Mark J; Coyle, Jeremy; Sofrygin, Oleg; Cai, Wilson; Nguyen, Anna; Pokpongkiat, Nolan N; Djajadi, Stephanie; Seth, Anmol; Jilek, Wendy; Jung, Esther; Chung, Esther O; Rosete, Sonali; Hejazi, Nima; Malenica, Ivana; Li, Haodong; Hafen, Ryan; Subramoney, Vishak; Häggström, Jonas; Norman, Thea; Brown, Kenneth H; Christian, Parul; Arnold, Benjamin F.

Nature ; 621(7979): 550-557, 2023 Sep.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37704719

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10511325
https://dx.doi.org/10.1038/s41586-023-06418-5

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5.

Distinguishing features of long COVID identified through immune profiling.

Klein, Jon; Wood, Jamie; Jaycox, Jillian R; Dhodapkar, Rahul M; Lu, Peiwen; Gehlhausen, Jeff R; Tabachnikova, Alexandra; Greene, Kerrie; Tabacof, Laura; Malik, Amyn A; Silva Monteiro, Valter; Silva, Julio; Kamath, Kathy; Zhang, Minlu; Dhal, Abhilash; Ott, Isabel M; Valle, Gabrielee; Peña-Hernández, Mario; Mao, Tianyang; Bhattacharjee, Bornali; Takahashi, Takehiro; Lucas, Carolina; Song, Eric; McCarthy, Dayna; Breyman, Erica; Tosto-Mancuso, Jenna; Dai, Yile; Perotti, Emily; Akduman, Koray; Tzeng, Tiffany J; Xu, Lan; Geraghty, Anna C; Monje, Michelle; Yildirim, Inci; Shon, John; Medzhitov, Ruslan; Lutchmansingh, Denyse; Possick, Jennifer D; Kaminski, Naftali; Omer, Saad B; Krumholz, Harlan M; Guan, Leying; Dela Cruz, Charles S; van Dijk, David; Ring, Aaron M; Putrino, David; Iwasaki, Akiko.

Nature ; 623(7985): 139-148, 2023 Nov.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37748514

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10620090
https://dx.doi.org/10.1038/s41586-023-06651-y

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6.

An open science study of ageing in companion dogs.

Creevy, Kate E; Akey, Joshua M; Kaeberlein, Matt; Promislow, Daniel E L.

Nature ; 602(7895): 51-57, 2022 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35110758

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8940555
https://dx.doi.org/10.1038/s41586-021-04282-9

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7.

Gut microbiota modulates weight gain in mice after discontinued smoke exposure.

Fluhr, Leviel; Mor, Uria; Kolodziejczyk, Aleksandra A; Dori-Bachash, Mally; Leshem, Avner; Itav, Shlomik; Cohen, Yotam; Suez, Jotham; Zmora, Niv; Moresi, Claudia; Molina, Shahar; Ayalon, Niv; Valdés-Mas, Rafael; Hornstein, Shanni; Karbi, Hodaya; Kviatcovsky, Denise; Livne, Adi; Bukimer, Aurelie; Eliyahu-Miller, Shimrit; Metz, Alona; Brandis, Alexander; Mehlman, Tevie; Kuperman, Yael; Tsoory, Michael; Stettner, Noa; Harmelin, Alon; Shapiro, Hagit; Elinav, Eran.

Nature ; 600(7890): 713-719, 2021 12.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34880502

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8.

Repeated cross-sectional sero-monitoring of SARS-CoV-2 in New York City.

Stadlbauer, Daniel; Tan, Jessica; Jiang, Kaijun; Hernandez, Matthew M; Fabre, Shelcie; Amanat, Fatima; Teo, Catherine; Arunkumar, Guha Asthagiri; McMahon, Meagan; Capuano, Christina; Twyman, Kathryn; Jhang, Jeffrey; Nowak, Michael D; Simon, Viviana; Sordillo, Emilia Mia; van Bakel, Harm; Krammer, Florian.

Nature ; 590(7844): 146-150, 2021 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33142304

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9.

The impact of cell size on morphogen gradient precision.

Adelmann, Jan A; Vetter, Roman; Iber, Dagmar.

Development ; 150(10)2023 05 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37249125

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10281552
https://dx.doi.org/10.1242/dev.201702

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10.

Environmental influences on the pace of brain development.

Tooley, Ursula A; Bassett, Danielle S; Mackey, Allyson P.

Nat Rev Neurosci ; 22(6): 372-384, 2021 06.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33911229

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8081006
https://dx.doi.org/10.1038/s41583-021-00457-5

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11.

Statin therapy is associated with lower prevalence of gut microbiota dysbiosis.

Vieira-Silva, Sara; Falony, Gwen; Belda, Eugeni; Nielsen, Trine; Aron-Wisnewsky, Judith; Chakaroun, Rima; Forslund, Sofia K; Assmann, Karen; Valles-Colomer, Mireia; Nguyen, Thi Thuy Duyen; Proost, Sebastian; Prifti, Edi; Tremaroli, Valentina; Pons, Nicolas; Le Chatelier, Emmanuelle; Andreelli, Fabrizio; Bastard, Jean-Phillippe; Coelho, Luis Pedro; Galleron, Nathalie; Hansen, Tue H; Hulot, Jean-Sébastien; Lewinter, Christian; Pedersen, Helle K; Quinquis, Benoit; Rouault, Christine; Roume, Hugo; Salem, Joe-Elie; Søndertoft, Nadja B; Touch, Sothea; Dumas, Marc-Emmanuel; Ehrlich, Stanislav Dusko; Galan, Pilar; Gøtze, Jens P; Hansen, Torben; Holst, Jens J; Køber, Lars; Letunic, Ivica; Nielsen, Jens; Oppert, Jean-Michel; Stumvoll, Michael; Vestergaard, Henrik; Zucker, Jean-Daniel; Bork, Peer; Pedersen, Oluf; Bäckhed, Fredrik; Clément, Karine; Raes, Jeroen.

Nature ; 581(7808): 310-315, 2020 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32433607

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12.

Brain volume, energy balance, and cardiovascular health in two nonindustrial South American populations.

Kaplan, Hillard; Hooper, Paul L; Gatz, Margaret; Mack, Wendy J; Law, E Meng; Chui, Helena C; Sutherland, M Linda; Sutherland, James D; Rowan, Christopher J; Wann, L Samuel; Allam, Adel H; Thompson, Randall C; Michalik, David E; Lombardi, Guido; Miyamoto, Michael I; Eid Rodriguez, Daniel; Copajira Adrian, Juan; Quispe Gutierrez, Raul; Beheim, Bret A; Cummings, Daniel K; Seabright, Edmond; Alami, Sarah; R Garcia, Angela; Buetow, Kenneth; Thomas, Gregory S; Finch, Caleb E; Stieglitz, Jonathan; Trumble, Benjamin C; Gurven, Michael D; Irimia, Andrei.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(13): e2205448120, 2023 03 28.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36940322

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10068758
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2205448120

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13.

Commemorating local victims of past atrocities and far-right support over time.

Turkoglu, Oguzhan; Ditlmann, Ruth; Firestone, Berenike.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(28): e2221158120, 2023 07 11.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37399412

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10334769
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2221158120

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14.

Epigenetic-based age acceleration in a representative sample of older Americans: Associations with aging-related morbidity and mortality.

Faul, Jessica D; Kim, Jung Ki; Levine, Morgan E; Thyagarajan, Bharat; Weir, David R; Crimmins, Eileen M.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(9): e2215840120, 2023 02 28.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36802439

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9992763
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2215840120

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15.

Environmental fluctuations explain the universal decay of species-abundance correlations with phylogenetic distance.

Sireci, Matteo; Muñoz, Miguel A; Grilli, Jacopo.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(37): e2217144120, 2023 09 12.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37669363

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10500273
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2217144120

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16.

Mapping human brain charts cross-sectionally and longitudinally.

Di Biase, Maria A; Tian, Ye Ella; Bethlehem, Richard A I; Seidlitz, Jakob; Alexander-Bloch, Aaron F; Yeo, B T Thomas; Zalesky, Andrew.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(20): e2216798120, 2023 05 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37155868

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https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2216798120

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17.

White-tailed deer (Odocoileus virginianus) may serve as a wildlife reservoir for nearly extinct SARS-CoV-2 variants of concern.

Caserta, Leonardo C; Martins, Mathias; Butt, Salman L; Hollingshead, Nicholas A; Covaleda, Lina M; Ahmed, Sohel; Everts, Mia R R; Schuler, Krysten L; Diel, Diego G.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(6): e2215067120, 2023 02 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36719912

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https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2215067120

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18.

Human white matter myelinates faster in utero than ex utero.

Grotheer, Mareike; Bloom, David; Kruper, John; Richie-Halford, Adam; Zika, Stephanie; Aguilera González, Vicente A; Yeatman, Jason D; Grill-Spector, Kalanit; Rokem, Ariel.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(33): e2303491120, 2023 08 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37549280

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https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2303491120

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19.

Burkitt lymphoma risk shows geographic and temporal associations with Plasmodium falciparum infections in Uganda, Tanzania, and Kenya.

Broen, Kelly; Dickens, Joey; Trangucci, Rob; Ogwang, Martin D; Tenge, Constance N; Masalu, Nestory; Reynolds, Steven J; Kawira, Esther; Kerchan, Patrick; Were, Pamela A; Kuremu, Robert T; Wekesa, Walter N; Kinyera, Tobias; Otim, Isaac; Legason, Ismail D; Nabalende, Hadija; Buller, Ian D; Ayers, Leona W; Bhatia, Kishor; Biggar, Robert J; Goedert, James J; Wilson, Mark L; Mbulaiteye, Sam M; Zelner, Jon.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(2): e2211055120, 2023 01 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36595676

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9926229
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2211055120

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20.

Immunological memory to SARS-CoV-2 infection and COVID-19 vaccines.

Sette, Alessandro; Crotty, Shane.

Immunol Rev ; 310(1): 27-46, 2022 09.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35733376

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9349657
https://dx.doi.org/10.1111/imr.13089

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